2009年9月4日，全國高新技術企業(yè)認定管理工作領導小組第二次會議在北京召開。領導小組組長、科技部萬鋼部長，領導小組副組長、財政部王軍副部長和稅務總局王力副局長出席會議。會議由領導小組副組長、科技部杜占元副部長主持，領導小組全體成員參加了本次會議。
　　在此次會議上，領導小組辦公室主任梁桂向領導小組做《高新技術企業(yè)認定管理工作報告》。在聽取工作報告后，王軍副部長、王力副局長對去年的認定管理工作表示肯定，認為高新技術企業(yè)政策導向正確，成效顯著。下一步的工作重點應加大對政策的宣傳力度，爭取各方面的理解與支持。要加強認定工作的制度化建設，加強監(jiān)管與培訓，爭取認定管理工作再上新臺階。
　　萬鋼部長做了總結講話。他首先肯定了科技、財政、稅務三部門的聯合工作機制和高新技術企業(yè)認定管理工作一年來所取得的成績，并感謝財政部和稅務總局對這項工作的大力支持。萬部長強調，高新技術企業(yè)政策關系企業(yè)切身利益和國家長遠發(fā)展，2008年的認定管理工作時間緊、任務重，又恰逢國際金融危機，全國高新技術企業(yè)領導小組辦公室和各地方認定機構頂住壓力，較好地完成了2008年的工作，篩選出了一大批具有較強研發(fā)能力和創(chuàng)新能力的企業(yè)，并使其享受到了稅收優(yōu)惠政策，這充分說明三部門的聯合工作機制卓有成效。
　　萬部長總結概括了新的高新技術企業(yè)政策的重要作用：一是為企業(yè)提供了“兩個動力”，即促進高新技術企業(yè)發(fā)展的動力和減少企業(yè)負擔的動力；二是經過一年的實施，新的高新技術企業(yè)政策取得了“兩個成果”，即提升了高新技術企業(yè)的創(chuàng)新能力和營利能力，同時初步發(fā)揮出了稅收優(yōu)惠政策帶來的稅收增長杠桿效應；三是新的高新技術企業(yè)認定管理工作需要正視“兩個壓力”，即經濟下行的壓力和各方面需求的壓力；四是在今后的認定管理工作中要繼續(xù)堅持“兩個原則”，即堅持結構調整的原則和保障稅收的原則。萬部長對下一步工作做出指示，一是要加強對政策的宣傳力度，二是啟動對2008年的檢查工作，三是著手進行政策的完善工作。